RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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tagAtoms() :
RDKit::MolDraw2D
,
RDKit::MolDraw2DSVG
tagAtomsWithCoords() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
TagMask :
RDKit::RDValue
Tags :
RDKit::MolPickler
,
RDKit::ReactionPickler
takeOwnership :
RDKit::GeneralMolSupplier::SupplierOptions
TargetAtomIdx :
RDKit::FMCS::TargetMatch
TargetBondIdx :
RDKit::FMCS::TargetMatch
TargetMatch() :
RDKit::FMCS::TargetMatch
TArray2D() :
RDKit::FMCS::TArray2D< T >
Tautomer() :
RDKit::MolStandardize::Tautomer
tautomer :
RDKit::MolStandardize::Tautomer
TAUTOMER_TRANSFORMED :
RDKit::StructureCheck::StructChecker
TautomerBundle_T :
RDKit::ExtendedQueryMol
,
RDKit::GeneralizedSubstruct::ExtendedQueryMol
TautomerCatalogEntry() :
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogEntry
TautomerCatalogParams() :
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogParams
TautomerEnumerator :
RDKit::MolStandardize::Tautomer
,
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumerator
,
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorResult
TautomerEnumeratorCallback() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorCallback
TautomerEnumeratorResult() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorResult
TautomerPatternHolder() :
RDKit::TautomerPatternHolder
TautomerQuery() :
RDKit::TautomerQuery
TautomerQuery_T :
RDKit::ExtendedQueryMol
,
RDKit::GeneralizedSubstruct::ExtendedQueryMol
TautomerQueryMatcher :
RDKit::TautomerQuery
tautomerReassignStereo :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
tautomerRemoveBondStereo :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
tautomerRemoveIsotopicHs :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
tautomerRemoveSp3Stereo :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
tautomers() :
RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorResult
TautomerTransform() :
RDKit::MolStandardize::TautomerTransform
tautomerTransformData :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
tautomerTransforms :
RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
Td :
type_caster< boost::shared_ptr< T > >
TDTMolSupplier() :
RDKit::v1::TDTMolSupplier
,
RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
TDTWriter() :
RDKit::TDTWriter
tee :
boost::logging::rdLogger
teestream :
boost::logging::rdLogger
TEMPLATE_TRANSFORMED :
RDKit::StructureCheck::StructChecker
Tetrahedral() :
RDKit::CIPLabeler::Tetrahedral
text :
RDKit::MarvinCondition
,
RDKit::MolDraw2D_detail::SGroupDataLabel
text_ :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawAnnotation
text_drawer_ :
RDKit::MolDraw2D
textDrawer_ :
RDKit::MolDraw2D_detail::AtomSymbol
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawAnnotation
,
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
theta0 :
ForceFields::MMFF::MMFFAngle
,
ForceFields::UFF::AtomicParams
,
ForceFields::UFF::UFFAngle
ThisType :
RDKit::AromaticAtomIterator_< Atom_, Mol_ >
,
RDKit::AtomIterator_< Atom_, Mol_ >
,
RDKit::HeteroatomIterator_< Atom_, Mol_ >
,
RDKit::MatchingAtomIterator_< Atom_, Mol_ >
,
RDKit::QueryAtomIterator_< Atom_, Mol_ >
THREEANDAHALF :
RDKit::Bond
THREECENTER :
RDKit::Bond
Threshold :
RDKit::MCSParameters
threshold :
RDKit::MolStandardize::Is2DValidation
,
RDPickers::LeaderPickerState< T >
tieStoreSize() :
RDKit::RGroupScorer
Timeout :
RDKit::MCSParameters
timeOut :
RDKit::SynthonSpaceSearch::ShapeBuildParams
,
RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSearchParams
timeout :
RDKit::DGeomHelpers::EmbedParameters
,
RDKit::RascalMCES::RascalOptions
,
RDKit::RGroupDecompositionParameters
TIndexEntry :
RDKit::FMCS::SubstructureCache
title :
RDKit::MarvinMonomerSgroup
,
RDKit::MarvinMultipleSgroup
,
RDKit::MarvinSruCoModSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroupExpanded
titleLine :
RDKit::GeneralMolSupplier::SupplierOptions
,
RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplierParams
TKey :
RDKit::FMCS::SubstructureCache
to_enum() :
better_enums::map< Enum, T, Compare >
to_enum_nothrow() :
better_enums::map< Enum, T, Compare >
toBinary() :
RDKit::ExtendedQueryMol
,
RDKit::GeneralizedSubstruct::ExtendedQueryMol
toJSON() :
RDKit::AtomEnvironmentGenerator< OutputType >
,
RDKit::AtomInvariantsGenerator
,
RDKit::AtomPair::AtomPairArguments
,
RDKit::AtomPair::AtomPairAtomInvGenerator
,
RDKit::AtomPair::AtomPairEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::BondInvariantsGenerator
,
RDKit::ExtendedQueryMol
,
RDKit::FingerprintArguments
,
RDKit::FingerprintGenerator< OutputType >
,
RDKit::GeneralizedSubstruct::ExtendedQueryMol
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganArguments
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganAtomInvGenerator
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganBondInvGenerator
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::MorganFingerprint::MorganFeatureAtomInvGenerator
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPArguments
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPAtomInvGenerator
,
RDKit::RDKitFP::RDKitFPEnvGenerator< OutputType >
,
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionArguments
,
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionEnvGenerator< OutputType >
toMolPtree() :
RDKit::MarvinMol
TooManyNodesException() :
RDKit::CIPLabeler::TooManyNodesException
TopologicalTorsionArguments() :
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionArguments
TopologicalTorsionAtomEnv() :
RDKit::TopologicalTorsion::TopologicalTorsionAtomEnv< OutputType >
Topology :
RDKit::FMCS::Seed
,
RDKit::FMCS::Target
,
RDKit::StructureCheck::AugmentedAtom
toPtree() :
RDKit::MarvinArrow
,
RDKit::MarvinAtom
,
RDKit::MarvinAttachmentPoint
,
RDKit::MarvinBond
,
RDKit::MarvinBondStereo
,
RDKit::MarvinCondition
,
RDKit::MarvinDataSgroup
,
RDKit::MarvinGenericSgroup
,
RDKit::MarvinMol
,
RDKit::MarvinMolBase
,
RDKit::MarvinMonomerSgroup
,
RDKit::MarvinMulticenterSgroup
,
RDKit::MarvinMultipleSgroup
,
RDKit::MarvinPlus
,
RDKit::MarvinReaction
,
RDKit::MarvinSruCoModSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroupExpanded
torsion :
DistGeom::ZMatrix::InternalCoordinateReference
TorsionAngleContrib() :
ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib
,
ForceFields::UFF::TorsionAngleContrib
TorsionAngleContribM6() :
ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribM6
TorsionAngleContribs() :
ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribs
TorsionAngleContribsParams() :
ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribsParams
TorsionConstraintContrib() :
ForceFields::TorsionConstraintContrib
torsionDependence :
DistGeom::ZMatrix::ZMatrixRow
torsionIdx :
ForceFields::CrystalFF::CrystalFFDetails
,
ForceFields::CrystalFF::ExpTorsionAngle
,
ForceFields::CrystalFF::GaussianExpTorsionAngle
torsionParamKind :
ForceFields::CrystalFF::CrystalFFDetails
TorsionRange() :
DistGeom::TorsionRange
torsionRange :
RDKit::DGeomHelpers::InternalCoordinates
torsionRef :
DistGeom::ZMatrix::InternalCoordinateReference
TorsionValues() :
DistGeom::TorsionValues
toStream() :
RDCatalog::CatalogEntry
,
RDCatalog::CatalogParams
,
RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
,
RDKit::EnumerateLibrary
,
RDKit::EnumerateLibraryBase
,
RDKit::FilterCatalogEntry
,
RDKit::FilterCatalogParams
,
RDKit::FragCatalogEntry
,
RDKit::FragCatParams
,
RDKit::MolBundle
,
RDKit::MolCatalogEntry
,
RDKit::MolCatalogParams
,
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogParams
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::FragmentCatalogParams
,
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::TautomerCatalogParams
,
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogEntry
,
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogParams
,
RDKit::SubstructLibrary
,
RDKit::TautomerQuery
toString() :
BitVect
,
ChemicalFeatures::FreeChemicalFeature
,
ExplicitBitVect
,
Invar::Invariant
,
RDGeom::UniformGrid3D
,
RDGeom::UniformRealValueGrid3D
,
RDKit::CIPLabeler::PairList
,
RDKit::DiscreteValueVect
,
RDKit::GaussianShape::ShapeInput
,
RDKit::MarvinArrow
,
RDKit::MarvinAtom
,
RDKit::MarvinAttachmentPoint
,
RDKit::MarvinBond
,
RDKit::MarvinBondStereo
,
RDKit::MarvinCondition
,
RDKit::MarvinDataSgroup
,
RDKit::MarvinGenericSgroup
,
RDKit::MarvinMol
,
RDKit::MarvinMolBase
,
RDKit::MarvinMonomerSgroup
,
RDKit::MarvinMulticenterSgroup
,
RDKit::MarvinMultipleSgroup
,
RDKit::MarvinPlus
,
RDKit::MarvinReaction
,
RDKit::MarvinSruCoModSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroup
,
RDKit::MarvinSuperatomSgroupExpanded
,
RDKit::RealValueVect
,
RDKit::RGroupData
,
RDKit::RGroupMatch
,
RDKit::SparseIntVect< IndexType >
,
RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonShapeInput
,
SparseBitVect
totalNumHs :
RDKit::Canon::canon_atom
TotalSteps :
RDKit::FMCS::ExecStatistics
ToTautomer :
RDKit::StructureCheck::StructCheckerOptions
toTorsionRange() :
RDKit::DGeomHelpers::Path14Configuration
toTryChunkSize :
RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSearchParams
toUserString() :
Invar::Invariant
trackFailures :
RDKit::DGeomHelpers::EmbedParameters
traits_type :
boost_adaptbx::python::streambuf
traits_type_eof() :
boost_adaptbx::python::streambuf
Trajectory :
RDKit::Snapshot
,
RDKit::Trajectory
trajectory() :
RDKit::Snapshot
trans() :
RDKit::MolAlign::O3A
trans_ :
RDKit::MolDraw2D_detail::StringRect
Transform() :
RDDepict::EmbeddedAtom
,
RDDepict::EmbeddedFrag
Transform2D() :
RDGeom::Transform2D
Transform3D() :
RDGeom::Transform3D
transformAll() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
TransformCatalogEntry() :
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogEntry
TransformCatalogParams() :
RDKit::MolStandardize::TransformCatalogParams
transformCoords() :
RDKit::GaussianShape::ShapeInput
TRANSFORMED :
RDKit::StructureCheck::StructChecker
TRANSFORMED_SET :
RDKit::StructureCheck::StructChecker
TransformPoint() :
RDGeom::Transform2D
,
RDGeom::Transform3D
transformPoint() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
Translate() :
RDDepict::EmbeddedFrag
transpose() :
RDNumeric::Matrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
transposeInplace() :
RDNumeric::SquareMatrix< TYPE >
,
RDNumeric::SymmMatrix< TYPE >
trimOtherBondVecs() :
RDKit::MolDraw2D_detail::DrawShapeSolidWedge
trimSmallFrags() :
RDKit::RascalMCES::RascalResult
TRIPLE :
RDKit::Bond
tryEmbedding :
RDKit::EnumerateStereoisomers::StereoEnumerationOptions
TValue :
RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache
,
RDKit::FMCS::SubstructureCache::KeyNumericMetrics
TWOANDAHALF :
RDKit::Bond
TWOBITVALUE :
RDKit::DiscreteValueVect
type :
RDKit::Canon::MolStackElem
,
RDKit::CartesianProductStrategy
,
RDKit::Chirality::StereoInfo
,
RDKit::DGeomHelpers::TorsionValue
,
RDKit::EnumerationStrategyBase
,
RDKit::EvenSamplePairsStrategy
,
RDKit::GaussianShape::CustomFeature
,
RDKit::MarvinArrow
,
RDKit::RandomSampleAllBBsStrategy
,
RDKit::RandomSampleStrategy
,
RDKit::RDValue
,
RDKit::ScaffoldNetwork::NetworkEdge
type14 :
RDKit::DGeomHelpers::Path14Configuration
TypeConvert() :
Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
typeOfStereoGroup :
RDKit::Canon::canon_atom
Generated on
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