Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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- r -

• r : RDKit::DrawColour
• r0 : ForceFields::MMFF::MMFFBond, ForceFields::MMFF::MMFFCovRadPauEle, ForceFields::UFF::UFFBond
• r1 : ForceFields::UFF::AtomicParams
• R_ij_star : ForceFields::MMFF::MMFFVdWRijstarEps
• R_ij_starUnscaled : ForceFields::MMFF::MMFFVdWRijstarEps
• R_star : ForceFields::MMFF::MMFFVdW
• rad : RDKit::GaussianShape::CustomFeature
• Radical : RDKit::StructureCheck::AugmentedAtom, RDKit::StructureCheck::Ligand
• radical : RDKit::MarvinAtom
• radicals_ : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
• radii_ : RDKit::Descriptors::DoubleCubicLatticeVolume
• radius : RDKit::MolDraw2D_detail::LinePair
• randNegEig : RDKit::DGeomHelpers::EmbedParameters
• RandomAccessSupplierIter() : RDKit::v2::FileParsers::RandomAccessSupplierIter< Supplier >
• randomSample : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSearchParams
• RandomSampleAllBBsStrategy() : RDKit::RandomSampleAllBBsStrategy
• randomSampleFlipsAndPermutations() : RDDepict::EmbeddedFrag
• RandomSampleStrategy() : RDKit::RandomSampleStrategy
• randomSeed : RDKit::DGeomHelpers::EmbedParameters, RDKit::EnumerateStereoisomers::StereoEnumerationOptions, RDKit::MolEnumerator::MolEnumeratorParams, RDKit::SynthonSpaceSearch::ShapeBuildParams, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSearchParams
• range() : RDKit::MolDraw2D
• RangeQuery() : Queries::RangeQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
• RascalResult() : RDKit::RascalMCES::RascalResult
• rascalSearch() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• Rb0() : RDKit::atomicData
• rbegin() : DistGeom::ZMatrix, RDKit::v2::FileParsers::SDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
• RCore() : RDKit::RCore
• Rcov() : RDKit::atomicData
• RDAny() : RDKit::RDAny
• rdbase : RDKit::MolStandardize::CleanupParameters
• RDKitFPArguments() : RDKit::RDKitFP::RDKitFPArguments
• RDKitFPAtomEnv() : RDKit::RDKitFP::RDKitFPAtomEnv< OutputType >
• RDKitValidation() : RDKit::MolStandardize::RDKitValidation
• rdLogger() : boost::logging::rdLogger
• RDProps() : RDKit::RDProps
• RDValue() : RDKit::RDValue
• reactants : RDKit::MarvinReaction
• reaction_smarts : RDKit::Deprotect::DeprotectData
• ReactionFingerprintParams() : RDKit::ReactionFingerprintParams
• reactionFromPickle() : RDKit::ReactionPickler
• ReactionPickler : RDKit::ChemicalReaction
• ReactionPicklerException() : RDKit::ReactionPicklerException
• read() : RDKit::CustomPropHandler, RDKit::DataStructsExplicitBitVecPropHandler
• readDBFile() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• readFromDBStream() : RDKit::SynthonSpaceSearch::Synthon, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSet
• readMolProps() : RDKit::v2::FileParsers::ForwardSDMolSupplier
• readStream() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• readTextFile() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• reagentMaxMatchCount : RDKit::EnumerationParams
• RealValueVect() : RDKit::RealValueVect
• recalculateRects() : RDKit::MolDraw2D_detail::AtomSymbol
• recalculateScore() : RDKit::RGroupDecompositionChromosome
• RECHARGED : RDKit::StructureCheck::StructChecker
• rechargeMolecule() : RDKit::StructureCheck::ChargeFix
• rect_corr_ : RDKit::MolDraw2D_detail::StringRect
• rects_ : RDKit::MolDraw2D_detail::AtomSymbol, RDKit::MolDraw2D_detail::DrawAnnotation
• recursionPossible : RDKit::SubstructMatchParameters
• recursiveCompare() : RDKit::CIPLabeler::SequenceRule
• RecursiveLocker() : RDKit::detail::RecursiveLocker
• RecursiveStructureQuery() : RDKit::RecursiveStructureQuery
• ref() : RDKit::CIPLabeler::PairList
• refConf : RDKit::MolAlign::O3AFuncData
• reference : DistGeom::ZMatrix::Iterator, DistGeom::ZMatrix::TorsionDependence, RDKit::CXXAtomIterator< Graph, Vertex, Iterator, CheckedAtoms, CheckedBonds >::CXXAtomIter, RDKit::CXXBondIterator< Graph, Edge, Iterator, Checked >::CXXBondIter, RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorResult::const_iterator
• Reflect() : RDDepict::EmbeddedAtom, RDDepict::EmbeddedFrag, RDGeom::Transform3D
• refProp : RDKit::MolAlign::O3AFuncData
• registerProperty() : RDKit::Descriptors::Properties
• registry : RDKit::Descriptors::Properties
• reionize() : RDKit::MolStandardize::Reionizer
• reionizeInPlace() : RDKit::MolStandardize::Reionizer
• Reionizer() : RDKit::MolStandardize::Reionizer
• relabel() : RDKit::RGroupDecompData
• relabelCore() : RDKit::RGroupDecompData
• relabelRGroup() : RDKit::RGroupDecompData
• RemainingAtoms : RDKit::FMCS::Seed
• RemainingBonds : RDKit::FMCS::Seed
• RemainingSizeRejected : RDKit::FMCS::ExecStatistics
• remove() : RDKit::MolStandardize::FragmentRemover
• removeAgentTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
• removeAllHydrogenRGroups : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• removeAllHydrogenRGroupsAndLabels : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• removeAndTrackIsotopes : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeAtom() : RDKit::RWMol
• removeAtomFromGroups : RDKit::StereoGroup
• removeAtomWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• removeBond() : RDKit::RWMol
• removeBondFromGroups : RDKit::StereoGroup
• removeBondWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• removeCollisionsBondAndSpiroFlip() : RDDepict::EmbeddedFrag
• removeCollisionsBondFlip() : RDDepict::EmbeddedFrag
• removeCollisionsOpenAngles() : RDDepict::EmbeddedFrag
• removeCollisionsPathAngleExpansion() : RDDepict::EmbeddedFrag
• removeCollisionsShortenBonds() : RDDepict::EmbeddedFrag
• removeConformer() : RDKit::ROMol
• removeCoords() : RDKit::MarvinMolBase
• removeDefiningBondStereo : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeDegreeZero : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeDummyNeighbors : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeDuplicatesAndHs() : RDKit::CIPLabeler::Configuration
• removeEmptySynthonSets() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSet
• removeEntry() : RDKit::FilterCatalog
• removeHapticDummies : RDKit::MolStandardize::MetalDisconnectorOptions
• removeHigherDegrees : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeHs : RDKit::GeneralMolSupplier::SupplierOptions, RDKit::v1::PDBParserParams, RDKit::v1::SmilesParserParams, RDKit::v2::CDXMLParser::CDXMLParserParams, RDKit::v2::FileParsers::Mol2ParserParams, RDKit::v2::FileParsers::MolFileParserParams, RDKit::v2::FileParsers::PDBParserParams, RDKit::v2::MarvinParser::MrvParserParams, RDKit::v2::SmilesParse::SmilesParserParams
• removeHydrides : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeHydrogensPostMatch : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• removeInPlace() : RDKit::MolStandardize::FragmentRemover
• removeInSGroups : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeInternalEdges() : RDKit::CIPLabeler::Configuration
• removeIsotopes : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeMapped : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• RemoveMinorFragments : RDKit::StructureCheck::StructCheckerOptions
• removeNonimplicit : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeNontetrahedralNeighbors : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeOnlyHNeighbors : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeOwnedAtom() : RDKit::MarvinMol, RDKit::MarvinMolBase
• removeOwnedBond() : RDKit::MarvinMol, RDKit::MarvinMolBase
• removeParentAtomWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• removeRgroupData() : RDKit::VarianceDataForLabel
• removeSnapshot() : RDKit::Trajectory
• removeUnmappedProductTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
• removeUnmappedReactantTemplates() : RDKit::ChemicalReaction
• removeVarianceData() : RDKit::FingerprintVarianceScoreData
• removeWithQuery : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• removeWithWedgedBond : RDKit::MolOps::RemoveHsParameters
• rend() : DistGeom::ZMatrix, RDKit::v2::FileParsers::SDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
• RepeatUnitOp() : RDKit::MolEnumerator::RepeatUnitOp
• replaceAtom() : RDKit::RWMol
• replaceAtomBookmark() : RDKit::ROMol
• replaceBond() : RDKit::RWMol
• replaceCoreAtomsWithMolMatches() : RDKit::RCore
• replaceHydrogenCoreDummy() : RDKit::RGroupDecompData
• replacements : RDKit::v1::SmartsParserParams, RDKit::v1::SmilesParserParams, RDKit::v2::ReactionParser::ReactionSmartsParserParams, RDKit::v2::SmilesParse::SmartsParserParams, RDKit::v2::SmilesParse::SmilesParserParams
• reportAllFailures : RDKit::MolStandardize::PipelineOptions
• reportSynthonUsage() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• requiredElements : RDKit::MolStandardize::TautomerScoringFunctions::SubstructTerm
• reserve() : RDKit::Conformer
• reserved_tag : RDKit::RDValue
• reset() : RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >, RDKit::ControlCHandler, RDKit::Dict, RDKit::EnumerateLibraryBase, RDKit::ResonanceMolSupplier, RDKit::RingInfo, RDKit::v1::MolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::ForwardSDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::MolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
• resetEverything() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
• resetHolders() : RDKit::SubstructLibrary
• resetRingFamilies() : RDKit::RingInfo
• resetState() : RDKit::EnumerateLibraryBase
• resize() : RDKit::Conformer, RDKit::FMCS::TArray2D< T >
• resolveAtomSymbolClashes() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
• ResonanceFlags : RDKit::ResonanceMolSupplier
• ResonanceMolSupplier() : RDKit::ResonanceMolSupplier, RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
• ResonanceMolSupplierCallback() : RDKit::ResonanceMolSupplierCallback
• restoreBondDirs : RDKit::PNGMetadataParams
• ResultTuple : RDKit::MultiFPBReader
• returnEmptyMCES : RDKit::RascalMCES::RascalOptions
• reverse_iterator : DistGeom::ZMatrix, RDKit::v2::FileParsers::SDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
• revistedNeighbors : RDKit::Canon::canon_atom
• RGroupData() : RDKit::RGroupData
• RGroupDecompData() : RDKit::RGroupDecompData
• RGroupDecomposition() : RDKit::RGroupDecomposition
• RGroupDecompositionChromosome() : RDKit::RGroupDecompositionChromosome
• RGroupDecompositionParameters() : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• RGroupDecompositionProcessResult() : RDKit::RGroupDecompositionProcessResult
• RGroupGa() : RDKit::RGroupGa
• rgroupLabelling : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• RGroupMatch() : RDKit::RGroupMatch
• rgroupRef : RDKit::MarvinAtom
• rgroups : RDKit::RGroupMatch
• RGroupScorer() : RDKit::RGroupScorer
• rGroupScorer : RDKit::GaResult, RDKit::RGroupDecompData
• RigorousEnhancedStereoException() : RDKit::RigorousEnhancedStereoException
• RING : RDDepict::EmbeddedAtom
• RING_DUPLICATE : RDKit::CIPLabeler::Node
• RingInfo() : RDKit::RingInfo
• RingMatchesRingOnly : RDKit::MCSAtomCompareParameters, RDKit::MCSBondCompareParameters
• ringMatchesRingOnly : RDKit::RascalMCES::RascalOptions
• rmsThreshold : RDKit::SynthonSpaceSearch::ShapeBuildParams
• role() : RDKit::MarvinDataSgroup, RDKit::MarvinGenericSgroup, RDKit::MarvinMol, RDKit::MarvinMolBase, RDKit::MarvinMonomerSgroup, RDKit::MarvinMulticenterSgroup, RDKit::MarvinMultipleSgroup, RDKit::MarvinSruCoModSgroup, RDKit::MarvinSuperatomSgroup, RDKit::MarvinSuperatomSgroupExpanded
• rollbackBatchEdit() : RDKit::RWMol
• ROMol : RDKit::Atom, RDKit::Bond, RDKit::Conformer, RDKit::ROMol
• rootedAtAtom : RDKit::SmilesWriteParams
• rotate : RDKit::MolDrawOptions
• rotate90() : Point2D, RDGeom::Point2D, RDKit::MolDraw2D_detail::Point2D
• RotatePatterns : RDKit::StructureCheck::StructCheckerOptions
• rotDir : RDDepict::EmbeddedAtom
• Row() : RDKit::atomicData
• rSize : RDKit::DGeomHelpers::Path14Configuration
• Rule1a() : RDKit::CIPLabeler::Rule1a
• Rule1b() : RDKit::CIPLabeler::Rule1b
• Rule2() : RDKit::CIPLabeler::Rule2
• Rule3() : RDKit::CIPLabeler::Rule3
• Rule4a() : RDKit::CIPLabeler::Rule4a
• Rule4b() : RDKit::CIPLabeler::Rule4b
• Rule4c() : RDKit::CIPLabeler::Rule4c
• Rule5() : RDKit::CIPLabeler::Rule5
• Rule5New() : RDKit::CIPLabeler::Rule5New
• Rule6() : RDKit::CIPLabeler::Rule6
• Rules() : RDKit::CIPLabeler::Rules
• run() : RDKit::MolStandardize::Pipeline, RDKit::RGroupGa
• runBatch() : RDKit::RGroupGa
• runReactant() : RDKit::ChemicalReaction
• runReactants() : RDKit::ChemicalReaction
• Rvdw() : RDKit::atomicData
• RWMol : RDKit::Atom, RDKit::Bond, RDKit::ROMol, RDKit::RWMol
• RWMol_T : RDKit::ExtendedQueryMol, RDKit::GeneralizedSubstruct::ExtendedQueryMol
• rxn : RDKit::Deprotect::DeprotectData
• RxnSanitizeException() : RDKit::RxnSanitizeException