Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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O

P

Q

R

S

T

U

V

W

X

Z

_

~

- a -

• AbbreviationMatch() : RDKit::Abbreviations::AbbreviationMatch
• accumulateVotes() : RDInfoTheory::InfoBitRanker
• AcidBaseCatalogEntry() : RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogEntry
• AcidBaseCatalogParams() : RDKit::MolStandardize::AcidBaseCatalogParams
• add() : RDKit::CIPLabeler::Node, RDKit::CIPLabeler::PairList, RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache, RDKit::FMCS::SeedSet, RDKit::FMCS::SubstructureCache, RDKit::RGroupData, RDKit::RGroupDecompData::UsedLabels, RDKit::RGroupDecomposition
• addAgentTemplate() : RDKit::ChemicalReaction
• addAll() : RDKit::CIPLabeler::PairList
• addAtom() : RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey, RDKit::FMCS::Graph, RDKit::FMCS::Seed, RDKit::RWMol
• addAtoms() : RDKit::RGroupDecompData
• addAtomToMacroAtomBond() : RDKit::MacroMol
• addAtomWithBookmark() : RDKit::SubstanceGroup
• addAtomWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• addAttachPoint() : RDKit::SubstanceGroup
• addBinary() : RDKit::CachedMolHolder
• addBond() : RDKit::FMCS::DuplicatedSeedCache::TKey, RDKit::FMCS::Graph, RDKit::FMCS::Seed, RDKit::MacroBondInfo, RDKit::MacroMol, RDKit::RWMol
• addBondWithBookmark() : RDKit::SubstanceGroup
• addBondWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• addBracket() : RDKit::SubstanceGroup
• addCatalog() : RDKit::FilterCatalogParams
• addChild() : Queries::Query< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >, RDKit::FilterHierarchyMatcher
• addConformer() : RDKit::ROMol
• addConformersToMol() : RDKit::Trajectory
• addContrib() : DistGeom::ChiralViolationContribs, DistGeom::DistViolationContribs, DistGeom::FourthDimContribs, ForceFields::AngleConstraintContribs, ForceFields::CrystalFF::GaussianTorsionAngleContribs, ForceFields::CrystalFF::PlanarityContribs, ForceFields::CrystalFF::TorsionAngleContribs, ForceFields::DistanceConstraintContribs, ForceFields::UFF::InversionContribs
• addCore() : RDKit::RGroupDecompData
• addCoreUserLabels() : RDKit::RGroupDecompData
• addCState() : RDKit::SubstanceGroup
• addCustomPropHandler() : RDKit::MolPickler
• addDummyAtomsToUnlabelledCoreAtoms() : RDKit::RGroupDecompositionParameters
• addEdge() : RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >
• addElement() : DistGeom::ZMatrix
• addEntry() : RDCatalog::Catalog< entryType, paramType >, RDCatalog::HierarchCatalog< entryType, paramType, orderType >, RDKit::FilterCatalog
• addFeatureDef() : RDKit::MolChemicalFeatureFactory
• addFingerprint() : RDKit::FPHolderBase
• addFragsFromMol() : RDKit::FragCatGenerator
• addKey() : RDKit::KeyFromPropHolder, RDKit::KeyHolderBase
• addLeavingGroup() : RDKit::MacroMolTemplateBuilder
• addMacroAtom() : RDKit::MacroMol
• addMacroAtomToAtomBond() : RDKit::MacroMol
• addMacroBond() : RDKit::MacroMol
• addMol() : RDKit::CachedMolHolder, RDKit::CachedSmilesMolHolder, RDKit::CachedTrustedSmilesMolHolder, RDKit::FixedMolSizeMolBundle, RDKit::FPHolderBase, RDKit::KeyFromPropHolder, RDKit::KeyHolderBase, RDKit::MolBundle, RDKit::MolHolder, RDKit::MolHolderBase, RDKit::SubstructLibrary
• addMoleculeMetadata() : RDKit::MolDraw2DSVG
• addNode() : RDKit::CIPLabeler::Digraph
• addNoLineArcs() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMolMCHLasso
• addNonRingAtom() : RDDepict::EmbeddedFrag
• addParentAtomWithBookmark() : RDKit::SubstanceGroup
• addParentAtomWithIdx() : RDKit::SubstanceGroup
• addPattern() : RDKit::ExclusionList
• addPoint() : RDFeatures::ImplicitFeature< FAMILYMARKER, TYPEMARKER, LOCTYPE >
• addProductTemplate() : RDKit::ChemicalReaction
• addReactantTemplate() : RDKit::ChemicalReaction
• addReactionToPool() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• addReader() : RDKit::MultiFPBReader
• addRgroupData() : RDKit::VarianceDataForLabel
• addRing() : RDKit::RingInfo
• addRingFamily() : RDKit::RingInfo
• addRingSystemTemplates() : RDDepict::CoordinateTemplates
• addSgroupsToPtree() : RDKit::MarvinMolBase
• addSmiles() : RDKit::CachedSmilesMolHolder, RDKit::CachedTrustedSmilesMolHolder
• addSnapshot() : RDKit::Trajectory
• addSynthon() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSet
• addSynthonToPool() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpace
• addTemplate() : RDKit::MacroMolTemplateLibrary
• addTerm() : ForceFields::MMFF::AngleBendContrib, ForceFields::MMFF::BondStretchContrib, ForceFields::MMFF::EleContrib, ForceFields::MMFF::NonbondedContrib, ForceFields::MMFF::OopBendContrib, ForceFields::MMFF::StretchBendContrib, ForceFields::MMFF::TorsionAngleContrib, ForceFields::MMFF::VdWContrib
• addVarianceData() : RDKit::FingerprintVarianceScoreData
• adjustBondEndsForLabels() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
• adjustBondsOnSolidWedgeEnds() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMol
• adjustColons() : RDKit::MolDraw2D_detail::AtomSymbol
• adjustLineEndForHighlight() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawMolMCHCircleAndLine
• adjustLineForString() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
• AdjustQueryParameters() : RDKit::MolOps::AdjustQueryParameters
• adjustStringRectsForSuperSubScript() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText
• adjustToRemovedAtom() : RDKit::SubstanceGroup
• adjustToRemovedBond() : RDKit::SubstanceGroup
• align() : RDKit::MolAlign::O3A
• alignString() : RDKit::MolDraw2D_detail::DrawText, RDKit::MolDraw2D_detail::DrawTextNotFT
• allocateAtomCounts() : RDKit::AdditionalOutput
• allocateAtomsPerBit() : RDKit::AdditionalOutput
• allocateAtomToBits() : RDKit::AdditionalOutput
• allocateBitInfoMap() : RDKit::AdditionalOutput
• allocateBitPaths() : RDKit::AdditionalOutput
• AllowedAtomsValidation() : RDKit::MolStandardize::AllowedAtomsValidation
• And() : RDKit::FilterMatchOps::And
• AndQuery() : Queries::AndQuery< MatchFuncArgType, DataFuncArgType, needsConversion >
• AngleBendContrib() : ForceFields::MMFF::AngleBendContrib, ForceFields::UFF::AngleBendContrib
• AngleConstraintContrib() : ForceFields::AngleConstraintContrib
• AngleConstraintContribs() : ForceFields::AngleConstraintContribs
• AngleConstraintContribsParams() : ForceFields::AngleConstraintContribsParams
• angleTo() : Point2D, RDGeom::Point2D, RDGeom::Point3D, RDGeom::PointND, RDKit::MolDraw2D_detail::Point2D
• annotateProperties() : RDKit::Descriptors::Properties
• AnyOverLappingAtoms() : RDKit::MarvinMolBase
• append() : RDKit::MolAlign::O3AConstraintVect, RDKit::MolStandardize::PipelineResult
• applyQuatTrans() : RDKit::GaussianShape::SingleConformerAlignment
• applyTautomer() : RDKit::StructureCheck::StructCheckTautomer
• approxSimilarity() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceFingerprintSearcher, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceRascalSearcher, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSearcher, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceShapeSearcher, RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSpaceSubstructureSearcher
• areAtomsInSameRing() : RDKit::RingInfo
• areAtomsInSameRingOfSize() : RDKit::RingInfo
• areBondsInSameRing() : RDKit::RingInfo
• areBondsInSameRingOfSize() : RDKit::RingInfo
• areRingFamiliesInitialized() : RDKit::RingInfo
• areRingsFused() : RDKit::RingInfo
• AromaticAtomIterator_() : RDKit::AromaticAtomIterator_< Atom_, Mol_ >
• assertValidTemplate() : RDDepict::CoordinateTemplates
• assessRingFormers() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSet
• assign() : RDNumeric::Matrix< TYPE >, RDNumeric::Vector< TYPE >
• assignConnectorsUsed() : RDKit::SynthonSpaceSearch::SynthonSet
• at() : RDKit::FMCS::TArray2D< T >, RDKit::MolStandardize::TautomerEnumeratorResult
• atEnd() : RDKit::ResonanceMolSupplier, RDKit::v1::MolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::ForwardSDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::MolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SDMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::SmilesMolSupplier, RDKit::v2::FileParsers::TDTMolSupplier
• Atom() : RDKit::Atom
• atomBonds() : RDKit::ROMol
• AtomCompareFunctor() : RDKit::Canon::AtomCompareFunctor
• atomCoords() : RDKit::MolDraw2D
• AtomCoordsMatchFunctor() : RDKit::AtomCoordsMatchFunctor
• AtomFlipper() : RDKit::EnumerateStereoisomers::details::AtomFlipper
• atomicData() : RDKit::atomicData
• AtomicNum() : RDKit::atomicData
• AtomIterator_() : RDKit::AtomIterator_< Atom_, Mol_ >
• AtomKekulizeException() : RDKit::AtomKekulizeException
• atomMembers() : RDKit::RingInfo
• AtomMonomerInfo() : RDKit::AtomMonomerInfo
• atomNeighbors() : RDKit::ROMol
• AtomPairArguments() : RDKit::AtomPair::AtomPairArguments
• AtomPairAtomEnv() : RDKit::AtomPair::AtomPairAtomEnv< OutputType >
• AtomPairAtomInvGenerator() : RDKit::AtomPair::AtomPairAtomInvGenerator
• AtomPDBResidueInfo() : RDKit::AtomPDBResidueInfo
• atomRefInAtoms() : RDKit::MarvinMolBase
• atomRelevantCycles() : RDKit::RingInfo
• atomRingFamilies() : RDKit::RingInfo
• AtomRingQuery() : RDKit::AtomRingQuery
• atomRings() : RDKit::RingInfo
• atomRingSizes() : RDKit::RingInfo
• atoms() : RDKit::CIPLabeler::CIPMol, RDKit::ROMol
• AtomSanitizeException() : RDKit::AtomSanitizeException
• AtomSymbol() : RDKit::MolDraw2D_detail::AtomSymbol
• atomSyms() : RDKit::MolDraw2D
• AtomValenceException() : RDKit::AtomValenceException
• AtropisomerBond() : RDKit::CIPLabeler::AtropisomerBond
• AtropisomerFlipper() : RDKit::EnumerateStereoisomers::details::AtropisomerFlipper
• AttribType() : RDKit::SLNParse::AttribType
• AugmentedAtom() : RDKit::StructureCheck::AugmentedAtom
• autoGetLabels() : RDKit::RGroupDecompositionParameters